Dane kontaktowe: tel. 41 367 42 58
Kierownik zakładu:
dr hab. n. med. Artur Kowalik
spec. laboratoryjnej genetyki medycznej
oraz medycznej genetyki molekularnej
konsultant wojewódzki w dziedzinie laboratoryjnej genetyki medycznej
Z-ca kierownika: dr n. med. Małgorzata Chłopek - spec. laboratoryjnej genetyki medycznej
Działalność medyczna:
Zakład Diagnostyki Molekularnej wywodzi się z Pracowni Biologii Molekularnej utworzonej w 2003 roku w obrębie Zakładu Patologii Nowotworów. W 2008 roku Pracownia Biologii Molekularnej została wyłączona jako samodzielna Pracownia Diagnostyki Molekularnej, a w 2012 roku na bazie Pracowni utworzono Zakład Diagnostyki Molekularnej.
W skład Zakładu Diagnostyki Molekularnej wchodzi również BIOBANK ŚCO, który służy gromadzeniu materiału do badań naukowych.
Wykorzystujemy techniki:
- masywne równoległe sekwencjonowanie (next generation sequencing - NGS)
- sekwencjonowanie kapilarne
- MLPA
- qPCR, PCR, RT-PCR
- digital PCR
W Zakładzie wykonujemy badania technikami biologii molekularnej na potrzeby pacjentów leczonych w ŚCO. Wykonywane badania można podzielić na trzy główne typy:
- wykrywanie predyspozycji dziedzicznych do rozwoju chorób nowotworowych (np. BRCA1); badania te są realizowane w ścisłej współpracy z Poradnią Genetyczną ŚCO,
- stratyfikacja pacjentów do terapii celowanych (rak jelita grubego – KRAS, NRAS; czerniak-BRAF, niedrobnokomórkowy rak płuca- EGFR, rak jajnika, rak piersi, rak trzustki, rak prostaty -BRCA1/2),
- diagnostyka i monitorowanie skuteczności leczenia w nowotworach hematologicznych (np. CML, ALL, AML, PV i inne).
Działalność badawcza:
Działalność badawcza koncentruje się wokół poszukiwania nowych genów dla diagnostyki i terapii nowotworów z użyciem m. in. techniki NGS. Prowadzimy również badania dotyczące wykorzystania pozakomórkowych kwasów nukleinowych (cfNA) jako źródła materiału diagnostycznego tzw. „liquid biopsy”. Rozwijane są również badania dotyczące hodowli oraz zastosowania limfocytów naciekających guz nowotworowy (TILs) w terapii komórkowej chorób.
Personel:
- Diagności laboratoryjni:
mgr Anna Fatyga
mgr Krzysztof Gruszczyński
mgr Iwona Hraj
mgr Kamila Kubicka
mgr Ewelina Nowak-Ozimek
mgr Elżbieta Wypiórkiewicz
mgr Liliana Zięba
dr n. med. Sebastian Zięba – specjalista medycznej genetyki molekularnej - Biolodzy, biotechnolodzy:
mgr Magdalena Baćkowska
dr n. med. Kinga Hińcza-Nowak
mgr Katarzyna Korban
mgr Karol Krawczyk
mgr Dominika Ksel
dr Justyna Miłek-Krupa
mgr Patryk Nowakowski
mgr Angelika Odej
mgr Magdalena Stawiarz
mgr Magdalena Lipiec
mgr Magdalena Tyka - Sekretarka medyczna:
Dominika Walkowicz
- Pomoc Laboratoryjna:
Małgorzata Kwiecińska
Współpraca naukowo–badawcza:
Zakład prowadzi również badania naukowe z ośrodkami w kraju:
PIB-NIO Warszawa
Prof. dr hab. n. med. Magdalena Kowalewska
Współpraca w zakresie analizy biologii nowotworów ginekologicznych.
PIB-NIO Kraków
Prof. dr hab. n. med. Janusz Ryś
Współpraca w zakresie biologii mięsaków oraz nowotworów piersi.
Instytut Wysokich Ciśnień PAN
Prof. dr hab. Jan Weyher
Współpraca w zakresie wykorzystania podłoży SERS do ultraczułej diagnostyki.
Wydział Chemii, UW
Prof. dr hab. Andrzej Kudelski
Współpracujemy również z instytutami badawczymi z zagranicy:
Laboratory of Pathology, National Cancer Institute, NIH Bethesda, MD USA.
Dr Jerzy Lasota
Współpraca w zakresie badań biologii molekularnej nowotworów w tym GIST, czerniak oraz rak jelita grubego.
